Die Gemeinde Tiefenbach liegt auf einer Höhe zwischen 301 und 521 Meter und ist einer der südlichsten Ausläufer des Bayerischen Waldes, nordwestlich der Ilz und nördlich der Donau gelegen.
Die Universitätsstadt Passau liegt nur 9 Kilometer südlich von Tiefenbach entfernt. Der Tiefenbacher Raum gehört zum südlichen Teil des Passauer Abteilandes und der östliche Teil, entlang der Ilz, liegt im Landschaftsschutzgebiet "Ilztal". Ein südlicher Teil der Gemeinde liegt im Landschaftsschutzgebiet "Gaißatal".
